如何解决信息爆炸式增长中的信息安全、内容理解和数字鸿沟问题，越来越深刻地影响着一个国家的国家安全、社会和谐与国际竞争力。瞄准这一重大需求，自动化所利用在生物特征、语音、文字、图像等信息的智能化处理方面的学科优势，开展了大量卓有成效的工作，引领着相关领域的发展。
社会计算是自动化所开拓的一个崭新的研究领域，在国际上正成为一个新的热点方向，并为国家经济社会发展和社会稳定发挥越来越大的作用。
汉王手写汉字识别技术使国人摆脱了键盘鼠标，扫除了中文输入这一技术障碍，相关产品已经走进千家万户，为我国国民经济与社会信息化的发展做出了重大贡献，“汉王科技” 已经成为民族高科技产业的知名品牌。
近年来，凭借在计算机图形图像技术方面的长期积累，自动化所数字艺术中心自主创作的3D动画电影在信息技术与艺术的融合方面取得突破。《动物狂欢节》、《麋鹿王》分获第12届、13届电影华表奖优秀动画片奖。《水墨前后》获第15届“莫比斯”国际多媒体文化遗产创新奖，成为首个获得该奖项的中国作品。
在钱学森先生学术思想的指导下，以戴汝为院士为首的科研团队开展的人机结合综合集成研讨厅及其支撑环境的研究，是科学发展观的重要理论和技术支撑，它集中了专家群体的智慧和计算机的高性能，为国家与部门规划、发展预测、方案论证、决策支持和效果评估等提供了重要理论基础。综合集成研讨厅体系作为系统科学和复杂性科学界首次提出并系统阐述的方法论，是对系统科学和复杂性科学的原创性贡献。
2009年4月，自动化所承担的江苏省听力口语自动化考试项目圆满完成了对江苏省13个市近90万中考考生的英语考试听力答案和口语录音的全自动化评分，这是中国基础教育的第一次全自动大规模评估。
在计算医学与人类健康基础研究方面，研究所采用先进的现代医学成像技术，开展了对于针刺镇痛机理的研究，推翻了传统结论，引起了学术界的高度关注和兴趣。
2008年，“智能视频监控技术”和“人脸识别技术”成功应用于北京奥运会的安保工作中，保障了举世瞩目的北京奥运会开闭幕式的安全，保障了国家体育馆、奥林匹克中心区、奥林匹克公园等奥运场馆与场所的安全，不仅为奥运安保工作提供了有力的技术支持，也为中国科技奥运和平安奥运作出了积极贡献。
自动化所已成为世界上少数几家掌握虹膜识别核心算法的单位之一，其自主研发的虹膜识别产品打破了国外产品垄断国内虹膜识别市场的局面，并已经在煤矿、机场、狱政等领域得到了推广应用。
