自动化所韩华研究员团队通过其自主研发的电镜三维成像和快速重建技术，首次展现小鼠运动皮层锥体神经元胞体和树突中数百个线粒体的三维形态，发现神经元树突中线粒体依靠较细的“线粒体纳米管道”连接在一起（管道直径30-50纳米）的现象，有力支撑线粒体解码神经元活动的研究。
相关成果“Brain Activity Regulates Loose Coupling between Mitochondrial and Cytosolic Ca2+ Transients”2019年11月21日在线发表于《Nature Communications》，由北京大学分子医学研究所程和平院士团队领衔。该研究首次报道了脑神经元线粒体与胞质之间钙瞬变的概率性耦合以及其耦合度如何受大脑信息加工活动的调节,该成果揭示了脑内重要的细胞能量工厂-线粒体，是如何解码神经元活动模态，从而精准调控脑动态能量代谢的新现象和新机制。
作为该项研究的重要合作者，团队首先制备和成像重染细胞膜的小鼠运动皮层样品，获取皮层L1和L2/3区域的电镜三维数据（分辨率5nm*5nm*50nm、范围40.9um*40.9um*35.4um和81.9um*81.9um*19.2um）；其次，针对上述数据建立了一套高准确率的线粒体自动识别与快速重建方案，提取了大多数线粒体的精细三维结构；最后，运用统计分析发现，与神经元树突线粒体相比，胞体中线粒体的平均长度、平均体积和体积占比更少，表明线粒体在细胞内不同部位的分布与细胞局部的功能密切相关，具体结果见论文图1。
团队成员李琳琳博士（第2作者）、肖驰博士（第6作者）作为主要人员完成了上述研究，陈曦副研究员、李国庆副研究员、沈丽君博士、谢启伟教授、张丽娜工程师、马宏图工程师等在过程中给予了帮助和支持。
韩华研究员带领的脑微观重建与智能分析团队一直致力于解决微观神经大数据重建效率低下的难题，为脑科学和类脑智能研究提供突触水平神经结构重建所需的技术服务、解决方案和共享平台。团队从突触连接水平上解析脑网络结构和模型，从样品制备、自动切片、显微成像、图像合成及三维重建等关键技术攻关，提升数据获取和标注分析效率，将成像系统与上游的样品制备系统和下游的数据分析系统集成，成功研发突触水平神经大数据重建平台和生物高通量电镜三维影像系统，先后通过北京市和中科院的技术验收，形成了具有自主知识产权的一站式、大体量、高通量的微观脑图谱解决方案。同时，该方案在北京怀柔综合性国家科学中心脑认知功能图谱与类脑智能交叉研究平台中起到了重要支撑作用。
论文图1
突触水平神经大数据重建与分析平台
论文：Yuan Lin, Lin-Lin Li, Wei Nie, Xiaolei Liu, Avital Adler, Chi Xiao, Fujian Lu, Liping Wang, Hua Han, Xianhua Wang, Wen-Biao Gan , Heping Cheng .Brain activity regulates loose coupling between mitochondrial and cytosolic Ca2+ transients. Nature Communications 2019
