杨戈

杨戈  /  

  • 职  称: 研究员
  • 邮  编: 100190
  • 电子邮件: ge.yang@ia.ac.cn
  • 部门/实验室: 多模态人工智能系统全国重点实验室
  • 通讯地址: 北京市海淀区中关村东路95号中国科学院自动化研究所自动化大厦510

个人简历

01/2022~现在 中国科学院自动化研究所,多模态人工智能系统全国重点实验室,研究员
01/2019~现在 中国科学院大学,人工智能学院,长聘教授
01/2019~现在 中国科学院自动化研究所,模式识别国家重点实验室,研究员
07/2014~12/2018 美国卡内基梅隆大学,生物医学工程系和计算生物学系,副教授
10/2011~12/2018 美国卡内基梅隆大学,细胞力学与工程中心,成员
01/2009~12/2018 美国卡内基梅隆大学-匹兹堡大学计算生物学联合博士项目,教师
01/2009~06/2014 美国卡内基梅隆大学,生物医学工程系和计算生物学系,助理教授
01/2004~12/2008 美国加利福尼亚斯州克利普斯研究所,计算细胞生物学专业博士后
10/2001~01/2004 美国明尼苏达大学双城分校,机械工程专业(机器人学)博士
12/1998~10/2001 美国明尼苏达大学双城分校,机械工程专业(机器人学)硕士
09/1995~07/1998 中国科学院自动化研究所,自动控制专业(机器人学)硕士
09/1986~07/1991 清华大学,汽车工程专业和精密仪器自动控制专业双学士

研究方向

人工智能,计算机视觉,计算生物学,细胞生物学

承担科研项目情况

(1) 国家自然科学基金委员会, 重大研究计划, 92354307, 全细胞尺度细胞器互作网络时空图谱绘制与分析, 2024-01-01 至 2025-12-31, 主持
(2) 中国科学院, 战略性先导科技专项, XDB37040402, 生物大分子跨尺度结构研究前沿技术-子课题:大数据深度学习整合分析技术, 2020-01 至 2024-12, 主持
(3) 国家自然科学基金委员会, 重大研究计划, 91954201, 全细胞尺度溶酶体空间分布与互作调控的计算分析与建模, 2020-01-01 至 2023-12-31, 主持
(4) 国家自然科学基金委员会, 面上项目, 31971289, 基于深度学习的生物荧光显微图像分割关键技术研究与应用, 2020-01-01 至 2023-12-31, 主持

代表论著

(1) Guole Liu; Tongxin Niu; Mingxuan Qiu; Yun Zhu; Fei Sun; Ge Yang (2024) DeepETPicker: Fast and Accurate 3D Particle Picking for Cryo-Electron Tomograph Using Weakly Supervised Deep Learning, Nature Communications, 15: 2090
(2) Yanfeng Zhou; Jiaxing Huang; Chenlong Wang; Le Song; Ge Yang (2023) XNet: Wavelet-Based Low and High Frequency Fusion Networks for Fully- and Semi-Supervised Semantic Segmentation of
Biomedical Images, 2023 IEEE/CVF International Conference on Computer Vision (ICCV), pp. 21085-21096.
(3) Kaijie Zhu; Xixu Hu; Jindong Wang; Xing Xie; Ge Yang (2023) Improving Generalization of Adversarial Training via Robust Critical Fine-Tuning, 2023 IEEE/CVF International Conference on
Computer Vision (ICCV), pp. 4424-4434.
(4) Yating Zhou, Wenjing Li, Ge Yang (2023) SCTS: Instance Segmentation of Single Cells Using a Transformer-Based Semantic-Aware Model and Space-Filling Augmentation, 2023 IEEE/CVF Winter Conference on Applications of Computer Vision (WACV), pp. 5944-5953
(5) Yudong Zhang; Ge Yang (2023) A Motion Transformer for Single Particle Tracking in Fluorescence Microscopy Images, 2023 International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI), pp. 503-513.
(6) Yuanhao Guo; Di Shen; Yanfeng Zhou; Yutong Yang; Jinzhao Liang; Yating Zhou; Ningning Li; Yu Liu; Ge Yang; Wenjing Li (2022) Deep Learning-Based Morphological Classification of Endoplasmic Reticulum Under Stress, Frontiers in Cell and Developmental Biology, 9: 767866.
(7) Yaoru Luo; Guole Liu; Yuanhao Guo; Ge Yang (2022) Deep Neural Networks Learn Meta-Structures from Noisy Labels in Semantic Segmentation, 2022 AAAI Conference on Artificial Intelligence
(AAAI), 36(2), pp. 1908-1916.
(8) Tianjie Yang, Yaoru Luo, Wei Ji, Ge Yang (2021) Advancing Biological Super-Resolution Microscopy Through Deep Learning: A Brief Review, Biophysics Reports, 7(4):253-266.
(9) Wenjing Li, Shuhao Zhang, Ge Yang (2020) Dynamic Organization of Intracellular Organelle Networks, Wiley Interdisciplinary Reviews Mechanism of Diseases, e1505.
(10) Ba Q., Raghavan G., Kiselyov K., and Yang G. (2018), Whole-Cell Scale Dynamic Organization of Lysosomes Revealed by Spatial Statistical Analysis,  Cell Reports, 23(12): 3591-3606.

获奖及荣誉

2021~2022 中国科学院大学华为智能基座优秀教师奖
2020 中国科学院大学优秀教师奖
2015 国际电工电子学会生物医学图像会议最佳学生论文奖(指导学生:李浩志)
2014 国际图像物体计算模型会议最佳论文奖(指导学生:陈冠杰)
2014 卡内基梅隆大学伯克曼教师发展奖
2012 美国国家科学基金早期研究生涯(CAREER)奖
2009 卡内基梅隆大学与魏玛基金会魏玛教师奖

专利成果

(1) 李文静; 郭远昊; 杨戈; 用于确定内质网表型的方法及产品和用于药物筛选的方法,2021-06-22至2041-06-21, 中国,ZL202110150528.7.
(2) 刘国乐; 靳杰; 石浩; 降雨强; 杨戈; 杨涛;基于深度神经网络对活体细胞形态检测的方法及相关产品,2022-05-10至2042-05-10, 中国,ZN202110169830.7.
(3) 杨天杰; 何佳; 纪伟; 杨戈; 徐涛; 超分辨计算成像方法、装置、电子设备及存储介质,2023-11-03至2043-06-20, 中国,CN202310729159.6.
(4) 何佳; 孙文浩; 张艳; 孙飞; 杨戈; 自监督深度学习及构建各向同性超分辨率三维图像的方法,2023-05-05至2042-12-28, 中国,CN202211689462.X.
(5) 刘国乐; 牛彤欣; 裘梦轩; 孙飞; 杨戈; 朱赟; 基于深度学习的冷冻电镜颗粒挑选方法、装置和电子设备,2023-03-28至2042-10-20, 中国,CN202211284170.8.

社会任职

2021-present,Biological Imaging编委 2020-present,Biophysics Reports编委, 2016-2020, BMC Bioinformatics编委, 2012-2014,IEEE Signal Processing Letters编委, 2012-2014, 2015-2017, 国际电工电子学会生物图像与信号处理技术委员会委员 2021~现在 中国人工智能学会终身会员 2020~现在 中国细胞生物学会终身会员